More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0565 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  67.12 
 
 
223 aa  268  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  66.36 
 
 
230 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  63.8 
 
 
243 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  62.79 
 
 
223 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  63.64 
 
 
232 aa  248  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  59.73 
 
 
223 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  58.56 
 
 
223 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  58.9 
 
 
223 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  62.21 
 
 
223 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  59.36 
 
 
240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  63.18 
 
 
224 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  60.91 
 
 
223 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  63.18 
 
 
224 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  60.45 
 
 
223 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  57.83 
 
 
234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  58.64 
 
 
223 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  57.67 
 
 
222 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  60.62 
 
 
237 aa  237  9e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  57.4 
 
 
226 aa  234  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  57.47 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  62.33 
 
 
228 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  62.39 
 
 
222 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  56.36 
 
 
221 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  58.26 
 
 
222 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  55.66 
 
 
222 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  57.14 
 
 
221 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  52.97 
 
 
249 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  55.86 
 
 
229 aa  225  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  57.34 
 
 
225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  58.25 
 
 
210 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  56.88 
 
 
225 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  55.56 
 
 
229 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  54.75 
 
 
222 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  56.88 
 
 
225 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  55.2 
 
 
226 aa  221  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  56.88 
 
 
225 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  55.16 
 
 
225 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  54.94 
 
 
240 aa  218  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  50 
 
 
220 aa  217  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  54.01 
 
 
240 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  52.36 
 
 
239 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  52 
 
 
232 aa  215  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  52.59 
 
 
236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  53.3 
 
 
234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  48.37 
 
 
219 aa  202  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  51.1 
 
 
230 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  55.65 
 
 
240 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  48.37 
 
 
219 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  55.24 
 
 
229 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  55.24 
 
 
229 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  51.04 
 
 
250 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  51.98 
 
 
238 aa  201  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  51.54 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  50.88 
 
 
232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  48.72 
 
 
236 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  52.61 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  51.52 
 
 
239 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  51.52 
 
 
239 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  51.52 
 
 
239 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  51.52 
 
 
239 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  51.52 
 
 
239 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  51.3 
 
 
231 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  49.13 
 
 
241 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  51.08 
 
 
239 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  51.3 
 
 
240 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  51.3 
 
 
240 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  50.87 
 
 
240 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  51.77 
 
 
241 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  50.65 
 
 
245 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  44.44 
 
 
220 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  45.71 
 
 
220 aa  187  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  49.78 
 
 
232 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  52.23 
 
 
232 aa  185  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  48.88 
 
 
230 aa  185  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  50.93 
 
 
232 aa  184  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  49.78 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  48.7 
 
 
239 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  50 
 
 
239 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  50.43 
 
 
239 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  48.28 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  49.79 
 
 
245 aa  177  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  48.72 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  45.33 
 
 
251 aa  171  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  44.25 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  49.56 
 
 
234 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  42.48 
 
 
242 aa  169  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  48.74 
 
 
272 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  43.75 
 
 
274 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  45.49 
 
 
272 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  48.35 
 
 
263 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  47.95 
 
 
271 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  48.36 
 
 
271 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  44.49 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  43.38 
 
 
244 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  40.53 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  39.65 
 
 
250 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
240 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 
241 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>