More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0521 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
274 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  63.04 
 
 
285 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  60.39 
 
 
281 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  55.11 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  52.59 
 
 
283 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  60.16 
 
 
295 aa  269  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.88 
 
 
276 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  53.65 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  53.65 
 
 
275 aa  264  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.63 
 
 
277 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  49.63 
 
 
277 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  51.45 
 
 
294 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  49.26 
 
 
277 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.26 
 
 
277 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.26 
 
 
277 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  52.73 
 
 
279 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.26 
 
 
277 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.26 
 
 
277 aa  258  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.95 
 
 
277 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.89 
 
 
277 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.95 
 
 
277 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.95 
 
 
277 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.56 
 
 
277 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.26 
 
 
277 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  50.59 
 
 
279 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  46.43 
 
 
287 aa  255  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  46.57 
 
 
287 aa  255  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.72 
 
 
281 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.56 
 
 
277 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  55.91 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.18 
 
 
276 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.57 
 
 
281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.19 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  54.64 
 
 
280 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  54.38 
 
 
276 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.92 
 
 
276 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  54.01 
 
 
276 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  49.45 
 
 
277 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.28 
 
 
276 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  56.44 
 
 
280 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  45.15 
 
 
285 aa  245  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  52.07 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  51.27 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  54.33 
 
 
287 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  49.03 
 
 
284 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.66 
 
 
276 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  48.26 
 
 
284 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.27 
 
 
276 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.66 
 
 
276 aa  237  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  46.04 
 
 
285 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  54.2 
 
 
285 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  53.49 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.86 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  43.42 
 
 
288 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  44.7 
 
 
286 aa  232  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  53.79 
 
 
286 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  46.18 
 
 
284 aa  231  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
286 aa  231  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  52.29 
 
 
286 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  51.84 
 
 
287 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  53.91 
 
 
276 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  43.8 
 
 
282 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  50.18 
 
 
310 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  48.83 
 
 
283 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  49.63 
 
 
289 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.37 
 
 
283 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  47.25 
 
 
298 aa  224  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  46.69 
 
 
285 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  53.82 
 
 
285 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.72 
 
 
280 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  53.82 
 
 
285 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  44.31 
 
 
288 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  53.82 
 
 
285 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  53.82 
 
 
285 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  53.82 
 
 
285 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  53.82 
 
 
285 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  53.44 
 
 
285 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  47.88 
 
 
286 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  52.92 
 
 
311 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  50.79 
 
 
270 aa  222  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.89 
 
 
286 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  43.7 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  44.09 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  44.53 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.08 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  50 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.76 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  50 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  43.7 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  48.71 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  44.09 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  43.7 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  52.33 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.43 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  51.15 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  50.37 
 
 
283 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  42.97 
 
 
280 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  43.08 
 
 
280 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>