More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0492 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  75.76 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  80.65 
 
 		 69 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  79.69 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  75.38 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  75.38 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  80.65 
 
 		 69 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  79.03 
 
 		 69 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  79.03 
 
 		 69 aa  104  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  79.03 
 
 		 69 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  73.85 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  67.16 
 
 		 68 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1442  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0899  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1944  hypothetical protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0388  cold shock transcription regulator protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2559  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0164583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1853  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0482  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0167  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2676  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000256327  unclonable  1.4308e-18 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 68 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5524  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337597  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6397  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257839 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5888  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232235  normal  0.225892 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  71.64 
 
 		 70 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 70 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1002  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 70 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0476  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.528893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4995  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0002  cold shock-like transcription regulator protein  68.18 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000106276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0434  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  67.16 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3895  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3782  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0399631  normal  0.208523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0408  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0503  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0586  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>