More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0438 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 96 aa  185  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  83.33 
 
 		 96 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 		 96 aa  160  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 		 96 aa  160  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  80 
 
 		 96 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 		 95 aa  156  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 		 96 aa  150  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  70.83 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 		 96 aa  144  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 		 105 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 		 105 aa  143  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 		 105 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  69.47 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  71.58 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  71.58 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 		 105 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 		 105 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  64.58 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  72.92 
 
 		 96 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  64.58 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  64.58 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 		 105 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  68.09 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 97 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 97 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 97 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  68.42 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  69.07 
 
 		 97 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 95 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 104 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 95 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 96 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  133  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  68.04 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  67.01 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  67.01 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 95 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  65.98 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  65.98 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 97 aa  130  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 97 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 97 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 97 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  64.58 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>