26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0425 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  38.3 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  41.04 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  39.42 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  30.6 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  38.35 
 
 		 217 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  38.81 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  33.8 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  30.87 
 
 		 206 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  28.99 
 
 		 192 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  28.99 
 
 		 192 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  31.79 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  35.07 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  29.8 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  35.34 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2946  hypothetical protein  37.89 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3768  hypothetical protein  35.11 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  39.02 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0720  protein of unknown function DUF1018  44.07 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.915248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1653  bacteriophage protein  37.36 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3358  hypothetical protein  45.61 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.63409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  26.47 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>