More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0372 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  47.29 
 
 
745 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.89 
 
 
810 aa  677    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  47.27 
 
 
731 aa  657    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  62.82 
 
 
789 aa  972    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  100 
 
 
750 aa  1511    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  45.43 
 
 
752 aa  596  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.43 
 
 
626 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.71 
 
 
586 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.18 
 
 
613 aa  515  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  44.89 
 
 
623 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  46 
 
 
642 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.03 
 
 
624 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  44.11 
 
 
616 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.11 
 
 
616 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  42.66 
 
 
630 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  41.97 
 
 
654 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.82 
 
 
628 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  42.76 
 
 
586 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  42.36 
 
 
649 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  42.41 
 
 
586 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  43.81 
 
 
577 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  43.79 
 
 
622 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  44.25 
 
 
608 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  43.99 
 
 
605 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  46.56 
 
 
604 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.88 
 
 
608 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  43.28 
 
 
623 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  42.33 
 
 
625 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  42 
 
 
629 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  41.19 
 
 
632 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  44.72 
 
 
639 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.44 
 
 
610 aa  422  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  39.58 
 
 
575 aa  414  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  38.79 
 
 
603 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  39.63 
 
 
626 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  38.9 
 
 
570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  41.02 
 
 
624 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.63 
 
 
613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.13 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.28 
 
 
614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.52 
 
 
628 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.59 
 
 
613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.28 
 
 
610 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.71 
 
 
619 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  42.86 
 
 
589 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.99 
 
 
654 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.83 
 
 
611 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  41.06 
 
 
611 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.71 
 
 
619 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.5 
 
 
604 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.35 
 
 
609 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
619 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  40.89 
 
 
611 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.71 
 
 
619 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  39.93 
 
 
618 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.42 
 
 
602 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.75 
 
 
631 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  40.24 
 
 
617 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  38.44 
 
 
589 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.92 
 
 
624 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  40.4 
 
 
615 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  40.4 
 
 
615 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  40.4 
 
 
615 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
592 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.74 
 
 
592 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.26 
 
 
606 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  38.2 
 
 
631 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.04 
 
 
600 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.33 
 
 
567 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  39.3 
 
 
610 aa  385  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.33 
 
 
567 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.16 
 
 
567 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.16 
 
 
567 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  40.64 
 
 
627 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.83 
 
 
602 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.16 
 
 
567 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  41 
 
 
577 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  38.67 
 
 
603 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.69 
 
 
616 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  38.53 
 
 
623 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  39.19 
 
 
614 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.108061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.17 
 
 
565 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.33 
 
 
565 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.23 
 
 
565 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  37.17 
 
 
565 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.33 
 
 
565 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.17 
 
 
565 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  37.06 
 
 
565 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.49 
 
 
563 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39 
 
 
612 aa  372  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  37 
 
 
565 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.44 
 
 
582 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.17 
 
 
565 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.61 
 
 
563 aa  368  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  38.42 
 
 
600 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.71 
 
 
624 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.09 
 
 
607 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  38 
 
 
648 aa  364  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.01 
 
 
595 aa  361  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.01 
 
 
595 aa  361  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>