282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0350 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  91.64 
 
 
622 aa  1184    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  90.84 
 
 
632 aa  1182    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 
622 aa  1301    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.88 
 
 
635 aa  617  1e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.08 
 
 
629 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  47.67 
 
 
627 aa  566  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.79 
 
 
657 aa  559  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.9 
 
 
634 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.98 
 
 
629 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.78 
 
 
635 aa  545  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.12 
 
 
625 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.97 
 
 
658 aa  547  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.56 
 
 
658 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.87 
 
 
662 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.38 
 
 
624 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.33 
 
 
667 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.62 
 
 
659 aa  532  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.11 
 
 
663 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.55 
 
 
664 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.12 
 
 
665 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.41 
 
 
664 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.43 
 
 
673 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.05 
 
 
591 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  35.7 
 
 
574 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.31 
 
 
594 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.85 
 
 
590 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.29 
 
 
579 aa  308  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.37 
 
 
563 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.24 
 
 
566 aa  286  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  27.69 
 
 
576 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  27.78 
 
 
569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  26.64 
 
 
574 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.18 
 
 
574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.18 
 
 
574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  25.94 
 
 
579 aa  170  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  25.96 
 
 
574 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  25 
 
 
579 aa  165  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  24.66 
 
 
579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  25.45 
 
 
579 aa  164  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  25.29 
 
 
579 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  25.29 
 
 
579 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  25.72 
 
 
579 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  26.04 
 
 
574 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  25.83 
 
 
591 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  24.88 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.73 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  26.02 
 
 
580 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25.57 
 
 
582 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  26.44 
 
 
578 aa  144  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  24.08 
 
 
578 aa  139  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.21 
 
 
556 aa  138  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  24.63 
 
 
583 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.56 
 
 
610 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  25.2 
 
 
580 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  24.18 
 
 
954 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  22.44 
 
 
573 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.05 
 
 
564 aa  76.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.19 
 
 
596 aa  74.7  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  23.92 
 
 
582 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.26 
 
 
577 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  20.81 
 
 
579 aa  67.4  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  22.04 
 
 
573 aa  66.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 
641 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.42 
 
 
603 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.95 
 
 
593 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.62 
 
 
595 aa  63.9  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.05 
 
 
566 aa  63.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.01 
 
 
583 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.47 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.83 
 
 
592 aa  62.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.85 
 
 
589 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.85 
 
 
589 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
599 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.86 
 
 
590 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.28 
 
 
583 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  21.11 
 
 
596 aa  61.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.26 
 
 
583 aa  60.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.47 
 
 
602 aa  60.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  20.74 
 
 
584 aa  60.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.24 
 
 
638 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.26 
 
 
599 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  23.23 
 
 
646 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.38 
 
 
596 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.03 
 
 
592 aa  59.3  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  21.08 
 
 
597 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.01 
 
 
595 aa  58.9  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.55 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.17 
 
 
597 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  22.24 
 
 
601 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.24 
 
 
601 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.95 
 
 
576 aa  58.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.22 
 
 
583 aa  57.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3527  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.32 
 
 
602 aa  57.8  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0312  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.03 
 
 
585 aa  57.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.77 
 
 
601 aa  57.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.87 
 
 
600 aa  57.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  20.96 
 
 
591 aa  57.4  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.85 
 
 
626 aa  57  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25820  succinate dehydrogenase subunit A  28.77 
 
 
612 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722118  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  22.57 
 
 
598 aa  57  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>