53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0341 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 171 aa  352  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  79.53 
 
 		 178 aa  290  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  39.88 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  39.88 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  33.11 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  32.75 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  29.45 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  32.94 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  29.09 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  28.73 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  29.09 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  26.99 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  32.16 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  27.37 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  30.41 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  29.65 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  31.76 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  26.95 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.4 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  29.3 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  26.51 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.59 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  29.3 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  24.39 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.18 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  27.39 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.68 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  30.77 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  24.39 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  31.79 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.28 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  29.86 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.52 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.11 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.6 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  31.13 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  29.37 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.8 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  25.86 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  30.07 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  26.29 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.03 
 
 		 181 aa  42  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  23.3 
 
 		 157 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2224  metallophosphoesterase  41.86 
 
 		 246 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  24.71 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  29.58 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  25 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>