17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0296 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  259  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  61.11 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  39.68 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  46.97 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  38.71 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  40.94 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  34.88 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  39.81 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  38.64 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  42.16 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  38.74 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  31.45 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  46.08 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  39.6 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  28.12 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  30.65 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>