More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0258 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 124 aa  254  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  62.39 
 
 		 116 aa  150  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  40.87 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.57 
 
 		 393 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45 
 
 		 389 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  45.71 
 
 		 361 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  36.52 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  35.65 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.9 
 
 		 480 aa  88.2  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.25 
 
 		 388 aa  87.4  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.11 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.35 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  36.61 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  46.15 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  33.91 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  38.94 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  35.96 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  42.53 
 
 		 346 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  37.27 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.51 
 
 		 354 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  39.82 
 
 		 438 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.08 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  33.04 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  39.51 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  40.71 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  36.52 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  37.36 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.18 
 
 		 386 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.53 
 
 		 379 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.02 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 415 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.43 
 
 		 378 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.73 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  42.27 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  43.21 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  33.96 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  28.04 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  37.5 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  37.61 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  32.46 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.1 
 
 		 478 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.18 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.18 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  35.96 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.42 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  32.11 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  43.84 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  34.12 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>