More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0241 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 675 aa  1359    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  51.9 
 
 		 688 aa  657    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  46.04 
 
 		 705 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  43.29 
 
 		 678 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  40.96 
 
 		 691 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  34.29 
 
 		 706 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  34.43 
 
 		 706 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  34.43 
 
 		 706 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  34.43 
 
 		 706 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 728 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  34.43 
 
 		 721 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 694 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 700 aa  355  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 705 aa  355  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 700 aa  355  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 700 aa  355  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 700 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 700 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 700 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  33.57 
 
 		 700 aa  352  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  33.57 
 
 		 700 aa  352  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 700 aa  351  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 706 aa  347  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 709 aa  346  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 715 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 731 aa  343  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 720 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 706 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.56 
 
 		 712 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 710 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 697 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 681 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 742 aa  318  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 701 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 680 aa  308  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  31.91 
 
 		 726 aa  306  9.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  31.79 
 
 		 743 aa  287  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 723 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 723 aa  258  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 736 aa  256  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 770 aa  203  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 742 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 703 aa  182  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 736 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 681 aa  173  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 688 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 698 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 734 aa  167  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 692 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 696 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 737 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.85 
 
 		 701 aa  154  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 682 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 706 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 715 aa  150  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 678 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 681 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 780 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 690 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 717 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.84 
 
 		 727 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 700 aa  140  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 702 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 716 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 733 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 711 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 705 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 730 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 698 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 688 aa  126  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  27.65 
 
 		 690 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 690 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 714 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 718 aa  120  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 702 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  21.66 
 
 		 762 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 769 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  25.3 
 
 		 712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 638 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 675 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 731 aa  114  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 757 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 776 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 664 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 657 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 776 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 746 aa  109  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.08 
 
 		 1023 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 728 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 742 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 688 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 703 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 723 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 769 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 708 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>