More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0199 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.97 
 
 
736 aa  707    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  49.64 
 
 
712 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
734 aa  1473    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.31 
 
 
729 aa  631  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  46 
 
 
734 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 
816 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 
708 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
710 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
725 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
718 aa  485  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
744 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  39.3 
 
 
710 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  41.7 
 
 
705 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
736 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  38.23 
 
 
806 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  38.23 
 
 
787 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  38.23 
 
 
802 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  38.23 
 
 
802 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  38.23 
 
 
802 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  38.23 
 
 
802 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  38.23 
 
 
802 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  38.37 
 
 
787 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
800 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
804 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
804 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
817 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
800 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
800 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
803 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
804 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
804 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
804 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.24 
 
 
811 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
781 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
812 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
765 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  36.44 
 
 
774 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
762 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
762 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
764 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
770 aa  379  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
764 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
776 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
772 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
823 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
775 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
765 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
780 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
827 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.98 
 
 
748 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
823 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
737 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
756 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
738 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
746 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
756 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
733 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
733 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
748 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
741 aa  297  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
756 aa  297  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
731 aa  291  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
754 aa  276  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
736 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
756 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
757 aa  267  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
749 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  31.35 
 
 
759 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
756 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
763 aa  265  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
752 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
845 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
760 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
752 aa  257  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
740 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
756 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
753 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
799 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
764 aa  249  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
759 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
745 aa  249  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  31.44 
 
 
799 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
799 aa  247  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  32.89 
 
 
767 aa  247  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
762 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.99 
 
 
742 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
784 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
753 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
763 aa  243  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
771 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
761 aa  241  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
762 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  29.17 
 
 
742 aa  239  9e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  29.43 
 
 
766 aa  238  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
814 aa  238  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
779 aa  237  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.96 
 
 
714 aa  236  9e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  29.48 
 
 
774 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>