100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0194 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
383 aa  769  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  50.64 
 
 
389 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  47.26 
 
 
345 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  43.12 
 
 
341 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  43.43 
 
 
341 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  42.3 
 
 
345 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  42.17 
 
 
352 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  43.64 
 
 
338 aa  268  9e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  43.67 
 
 
341 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  41.21 
 
 
341 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.9767e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  41.62 
 
 
341 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  41.21 
 
 
341 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  41.72 
 
 
338 aa  254  1e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.55 
 
 
393 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  38.58 
 
 
350 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  39.62 
 
 
341 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  35.96 
 
 
403 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  36.45 
 
 
343 aa  222  1e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  38.64 
 
 
349 aa  221  2e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
401 aa  213  3e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  38.02 
 
 
345 aa  213  6e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  38.02 
 
 
345 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  35.25 
 
 
387 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  36.32 
 
 
409 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  36.8 
 
 
394 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  37.16 
 
 
420 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  37.33 
 
 
426 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  37.06 
 
 
419 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  39.4 
 
 
405 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 
388 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  37.69 
 
 
390 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 
417 aa  201  2e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  35.33 
 
 
408 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  37 
 
 
395 aa  197  4e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  36.14 
 
 
364 aa  196  5e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  33.14 
 
 
374 aa  196  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 
430 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  32.37 
 
 
376 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  33.14 
 
 
365 aa  189  6e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  33.92 
 
 
377 aa  189  6e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  32.37 
 
 
376 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35775e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  32.37 
 
 
376 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  32.08 
 
 
376 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  32.25 
 
 
374 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.43599e-05 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  34.32 
 
 
366 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  31.95 
 
 
374 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  33.14 
 
 
367 aa  185  1e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  33.63 
 
 
377 aa  184  2e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  31.66 
 
 
374 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  35.42 
 
 
358 aa  183  5e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  33.6 
 
 
377 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  31.58 
 
 
378 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  32.94 
 
 
346 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  32.28 
 
 
368 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  31.07 
 
 
362 aa  174  2e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  32.94 
 
 
364 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  30.06 
 
 
361 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  31.49 
 
 
360 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  31.85 
 
 
364 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  33.44 
 
 
349 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  33.44 
 
 
349 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  30.58 
 
 
391 aa  165  1e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  31.44 
 
 
369 aa  164  2e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  32.65 
 
 
367 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  30.23 
 
 
353 aa  163  5e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  29.29 
 
 
369 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  32.51 
 
 
384 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  32.42 
 
 
384 aa  148  1e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  30.61 
 
 
359 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  31.29 
 
 
333 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.0411e-06  hitchhiker  3.23717e-12 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  30.53 
 
 
333 aa  141  2e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.22112e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  30.5 
 
 
335 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  28.74 
 
 
340 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.7016e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  30.24 
 
 
440 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  29.63 
 
 
440 aa  127  4e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 
440 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  27.95 
 
 
339 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  27.88 
 
 
331 aa  120  5e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  28.45 
 
 
435 aa  117  4e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  27.37 
 
 
338 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  27.72 
 
 
335 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.92 
 
 
429 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  32 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  26.64 
 
 
394 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.01658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  32.79 
 
 
167 aa  52.4  1e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  45.83 
 
 
377 aa  51.6  2e-05  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  47.27 
 
 
356 aa  52  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  41.67 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  30.84 
 
 
663 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.67 
 
 
1124 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  40.62 
 
 
935 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  37.18 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.43 
 
 
627 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0018  LysM domain-containing protein  39.47 
 
 
166 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.25361e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  35.44 
 
 
663 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  42.31 
 
 
203 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  39.06 
 
 
143 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  44.64 
 
 
205 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  35.44 
 
 
1079 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.78 
 
 
335 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>