287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0180 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
429 aa  867    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  71.22 
 
 
413 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  63.99 
 
 
412 aa  548  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.78 
 
 
412 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.93 
 
 
415 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  37.86 
 
 
409 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  36.52 
 
 
409 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  38.2 
 
 
425 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  37.2 
 
 
409 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  37.8 
 
 
416 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.39 
 
 
411 aa  260  4e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.78 
 
 
420 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.78 
 
 
420 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 
416 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.82 
 
 
447 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  39.76 
 
 
421 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  37.23 
 
 
423 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  36.1 
 
 
431 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.74 
 
 
418 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  35.75 
 
 
420 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  36.89 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  37.53 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  37.17 
 
 
415 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.35 
 
 
428 aa  242  9e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  35.12 
 
 
422 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.34 
 
 
428 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  36.71 
 
 
427 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  38.88 
 
 
430 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.83 
 
 
418 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  34.06 
 
 
423 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 
429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  36.32 
 
 
426 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.8 
 
 
415 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  37.35 
 
 
414 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  35.94 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  38.61 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  35.84 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.91 
 
 
427 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  36.99 
 
 
431 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.87 
 
 
415 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.45 
 
 
426 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  35.51 
 
 
425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  36.93 
 
 
427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  35.51 
 
 
425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
414 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  36.1 
 
 
415 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  36.8 
 
 
423 aa  232  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 
411 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  35.12 
 
 
415 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 
425 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 
423 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  34.39 
 
 
416 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.41 
 
 
523 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  35.84 
 
 
427 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 
411 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 
411 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 
411 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  34.47 
 
 
418 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
415 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  37.1 
 
 
429 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  35.05 
 
 
411 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  38.54 
 
 
442 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 
423 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
411 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  36.1 
 
 
431 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.05 
 
 
430 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
411 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
411 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  36.45 
 
 
411 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  36.45 
 
 
411 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 
415 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  35.84 
 
 
427 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  36.14 
 
 
420 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.73 
 
 
479 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
427 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.05 
 
 
419 aa  229  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.6 
 
 
426 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  35.18 
 
 
426 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  39.17 
 
 
420 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  36.17 
 
 
427 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  39.17 
 
 
420 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  39.17 
 
 
420 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  39.17 
 
 
420 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  39.17 
 
 
420 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  39.17 
 
 
420 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  35.44 
 
 
426 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  38.31 
 
 
422 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  35.18 
 
 
426 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  36.61 
 
 
429 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  35.42 
 
 
426 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  35.66 
 
 
421 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  35.8 
 
 
411 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  38.93 
 
 
420 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  35.42 
 
 
426 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  35.42 
 
 
426 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  34.93 
 
 
425 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  36.24 
 
 
459 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  36.24 
 
 
459 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.09 
 
 
407 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>