More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0157 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
646 aa  1290    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
543 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.88 
 
 
523 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.87 
 
 
640 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.16 
 
 
637 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.48 
 
 
638 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 
640 aa  264  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.43 
 
 
638 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.16 
 
 
638 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.28 
 
 
637 aa  264  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 
640 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.84 
 
 
638 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  46.03 
 
 
629 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  45.04 
 
 
642 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
551 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.32 
 
 
636 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  43.52 
 
 
550 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.29 
 
 
638 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  45.76 
 
 
633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  41.97 
 
 
712 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 
650 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.28 
 
 
542 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 
642 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.45 
 
 
712 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.53 
 
 
619 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  31.77 
 
 
627 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1012  hypothetical protein  34.5 
 
 
626 aa  250  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.2 
 
 
624 aa  249  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
541 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.79 
 
 
716 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.18 
 
 
572 aa  246  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0030  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 
660 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.136855  normal  0.0162002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  31.02 
 
 
627 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.23 
 
 
425 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  48.85 
 
 
647 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  41.93 
 
 
541 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
541 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 
674 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.96 
 
 
626 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
547 aa  240  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 
636 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.39 
 
 
411 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.69 
 
 
681 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 
541 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
679 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  40.1 
 
 
713 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.3 
 
 
544 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 
541 aa  239  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  41.08 
 
 
541 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  44.38 
 
 
676 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
541 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 
541 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.19 
 
 
552 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.59 
 
 
638 aa  238  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 
542 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 
541 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 
541 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
640 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.71 
 
 
546 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
542 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 
541 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  42.61 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  49.18 
 
 
647 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  41.8 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 
568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.81 
 
 
639 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  44 
 
 
640 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
627 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
522 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.1 
 
 
638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.96 
 
 
639 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.42 
 
 
568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 
638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.46 
 
 
547 aa  234  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 
639 aa  234  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
541 aa  233  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  47.88 
 
 
638 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2502  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
649 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.988754  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 
639 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
639 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 
548 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
541 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  42.46 
 
 
541 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  30.64 
 
 
633 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 
543 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
639 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
639 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  39.46 
 
 
559 aa  230  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
544 aa  230  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  42.54 
 
 
541 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 
647 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
541 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 
564 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.26 
 
 
547 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769572  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
541 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
674 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 
565 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
647 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>