More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0113 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  100 
 
 		 290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  45.64 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  42.76 
 
 		 401 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  48.78 
 
 		 292 aa  248  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  46.42 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  46.34 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10054  conserved hypothetical protein  35.18 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  32 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  29.86 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  29.86 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  29.86 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  29.86 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  29.86 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  27.21 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  26.22 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  23.74 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  27.97 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  27.97 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  23.74 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  29.41 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  29.41 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  26.47 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  28.04 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36053  predicted protein  30.67 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.630596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  27.49 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  30.31 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16505  Rfae domain I  26.55 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  29.02 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  27.34 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  30.59 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  28.72 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  28.72 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  29.89 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  28.72 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  28.72 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.66 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  22.84 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.09 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  30.08 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  30.61 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.14 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  25.91 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  29.37 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  29.86 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  30.24 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.25 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  30.28 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  27.82 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  28.22 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  30.51 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  26.59 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  31.08 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.4 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  25.99 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  26.11 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  22.81 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.09 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  23.45 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  26.91 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  26.91 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  26.91 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  28.37 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  26.91 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.58 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  23.57 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  26.91 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  23.96 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  27.44 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  26.91 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.22 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  23.32 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  23.62 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  24.41 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  23.32 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  29.08 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  23.57 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  24.24 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  23.57 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  23.57 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  23.47 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  23 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  23.23 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.57 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  23.47 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.47 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  26.46 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  25.78 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  23.47 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  26.51 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>