119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0096 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  100 
 
 		 131 aa  254  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  61.6 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  61.11 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  62.6 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  64.39 
 
 		 134 aa  153  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  54.4 
 
 		 134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  53.28 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  53.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  52.42 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  53.28 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  53.28 
 
 		 140 aa  123  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  47.58 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  51.61 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  52.42 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  51.64 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  50 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  45.53 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  55.26 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  49.19 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  50.41 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  52.14 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  47.58 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  52.25 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  46.77 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  49.11 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  43.31 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  43.31 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  45.16 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  40.65 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  42.86 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  50.82 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  38.71 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  47.22 
 
 		 129 aa  87.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  35.09 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  35.2 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.8 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  30.58 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.5 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.71 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  32.8 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  33.33 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  34.95 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  32.58 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  46.3 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  46.3 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  34.93 
 
 		 378 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  46.3 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.58 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  33.86 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.3 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  32 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  32.69 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  32.69 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  32.85 
 
 		 405 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  33.04 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  32.69 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  33.59 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  32.69 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  30.77 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  32.03 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  35.38 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  29.63 
 
 		 296 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  32.03 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  32.37 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  42 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  42 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.33 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  30.48 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  35.2 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  35.2 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  35.2 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  34.11 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  31.06 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  31.73 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  36.72 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  30.25 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  30.77 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  30.3 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  35.56 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  31.78 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  27.97 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  31.06 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35.66 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>