30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0085 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  216  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  49.44 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  48.61 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  41.94 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  51.69 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  47.06 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  47.3 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  34.91 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  48.53 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  47.83 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  41.33 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  48.57 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  44.93 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  43.48 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  43.48 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  43.48 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  44.93 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  36.96 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  43.48 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  37.14 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  48.53 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  48.53 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  42.37 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0447  hypothetical protein  42.42 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.145575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0389  hypothetical protein  42.42 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  37.88 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  39.71 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  39.71 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>