36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0072 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 396 aa  810    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  40.25 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  40.8 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  40.75 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  38.88 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  41 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  40.32 
 
 		 415 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  39.14 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1175  outer membrane porin FmdC, putative  27.46 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000392921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1417  hypothetical protein  24.23 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0157  hypothetical protein  25.19 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1473  hypothetical protein  23.95 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00085768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0983  hypothetical protein  26.21 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2000  hypothetical protein  26.68 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0056  hypothetical protein  23.09 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000444943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1055  hypothetical protein  24.03 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114803  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0073  phosphate-selective porin O and P  23.17 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0352  hypothetical protein  24.89 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000257502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0939  hypothetical protein  24.57 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000462454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1253  hypothetical protein  25.81 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00910104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2875  hypothetical protein  25.73 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0960  hypothetical protein  24.25 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000766698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5810  hypothetical protein  26.32 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960319 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0510  phosphate-selective porin O and P  24.28 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4495  hypothetical protein  24.16 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.394846 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0462  hypothetical protein  22.17 
 
 		 530 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.369233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1778  hypothetical protein  27.4 
 
 		 216 aa  53.1  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000267624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0272  hypothetical protein  23.96 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2236  hypothetical protein  23.95 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4458  hypothetical protein  21.72 
 
 		 458 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2588  phosphate-selective porin O and P  30 
 
 		 480 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0542  phosphate-selective porin O and P  28.93 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.63282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2208  phosphate-selective porin O and P  22.73 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.743142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2729  hypothetical protein  22.3 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.585762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1237  hypothetical protein  25.69 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  28.35 
 
 		 475 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>