221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0064 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  100 
 
 		 83 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  40.79 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  35.06 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  38.89 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  36 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  35.29 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  36.76 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  34.78 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  32.5 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  32.5 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  33.82 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  30.49 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  38.24 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  35.29 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  31.88 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  28.92 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  30.88 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  36.76 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  34.78 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  37.14 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  30.43 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  32.5 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  32.89 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  32.35 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  28.99 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  32.35 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  32.86 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  35.29 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  32.86 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  36.54 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  38.71 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  26.76 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  34.78 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  32.05 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  26.67 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  33.33 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  26.67 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  36.76 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  28.17 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  28.17 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  29.17 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  33.82 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  28.17 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  30.88 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  36.76 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  34.29 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  30.88 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  27.4 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  30.88 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  37.88 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  37.88 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  26.67 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  35.29 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  28.92 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  35.29 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  30.56 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  30.43 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  30.88 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  26.03 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  32.05 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  36.23 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  30.43 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  30.88 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  30.99 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  27.4 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  27.4 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  25.33 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  26.03 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  30 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  32.84 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  26.03 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  26.03 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  27.4 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  27.54 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  26.03 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  26.09 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  27.54 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  28.99 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>