More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0042 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  61.36 
 
 
223 aa  262  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  61.11 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  55.05 
 
 
220 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  51.36 
 
 
222 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.83 
 
 
231 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
226 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  39.21 
 
 
223 aa  145  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.67 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  34.67 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  39.13 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 
240 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.07 
 
 
231 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  28.26 
 
 
235 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  26.96 
 
 
231 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.07 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.57 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.35 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  36.44 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0276  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.320552  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
283 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  29.03 
 
 
235 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
258 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.73 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  29.49 
 
 
288 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.58 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  26.63 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2625  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.62 
 
 
310 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3471  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.62 
 
 
310 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02255  N5-glutamine methyltransferase  34.62 
 
 
310 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02215  hypothetical protein  34.62 
 
 
310 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0378  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.65 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  26.26 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1513  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.65 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.447698  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  32.2 
 
 
307 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1404  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.65 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1326  modification methylase, HemK family  33.65 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.695473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
363 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002862  hypothetical adenine-specific methylase yfcB  34.02 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1328  Methyltransferase type 12  28.92 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2482  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.65 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  31.31 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2708  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.65 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2487  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.65 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0920216  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.58 
 
 
310 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.83 
 
 
294 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.58 
 
 
310 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
260 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.53 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 
356 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.24 
 
 
257 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  24.6 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
270 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1322  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.65 
 
 
310 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  32.52 
 
 
307 aa  48.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.84 
 
 
252 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.27 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1896  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.56 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0838  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.74 
 
 
347 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  27.27 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_341  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase  28.07 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.96 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0831  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.74 
 
 
347 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000982153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0806  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.74 
 
 
347 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03115  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.99 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  32.74 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2167  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.96 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3530  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.74 
 
 
347 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.54 
 
 
343 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00656  Uncharacterized methyltransferase AN0656 (EC 2.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFM4]  27.46 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.529096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  28.07 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1700  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.99 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3375  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.73 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1030  methyltransferase type 12  26.14 
 
 
200 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 
362 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1419  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.56 
 
 
297 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000710273  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3164  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.68 
 
 
347 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1017  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.08 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>