87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0019 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  250  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  58.82 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  45.45 
 
 		 119 aa  103  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  40.98 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  37.6 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  37.19 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  38.33 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  36.29 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07570  hypothetical protein  35.54 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  34.23 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  33.63 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  26.5 
 
 		 125 aa  57  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  27.59 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  29.91 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  40.24 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  22.41 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  37.36 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  29.46 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  29.66 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  29.36 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  30.7 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  25.64 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  23.76 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  25 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  33.94 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  22.61 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  36.89 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  27.27 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  33.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  23.64 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  29.89 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.34 
 
 		 696 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  24.37 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  30.12 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  30.12 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  30.12 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  22.73 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  30.12 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  28.92 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  23 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  30.4 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  27.68 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  24.58 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  27.78 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  24.14 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  24.73 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  34.45 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  23.28 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  23.21 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  24.35 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  22.32 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  26.55 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  30.12 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  27.43 
 
 		 139 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  25.66 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2818  CoA-binding domain protein  39.29 
 
 		 744 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  41.38 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  26.89 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  28.36 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.43 
 
 		 698 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  30.16 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  30.38 
 
 		 715 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  25.42 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  34.38 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  32.91 
 
 		 725 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  25 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 698 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>