More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3115 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  68 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  76.06 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  57.14 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  57.47 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  68.57 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  68.57 
 
 		 76 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  54.67 
 
 		 75 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  70.77 
 
 		 76 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  70.77 
 
 		 76 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  53.33 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.52 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  58.97 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  50.6 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  50.6 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  58.11 
 
 		 77 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  67.65 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  61.43 
 
 		 74 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  51.32 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  60.81 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  61.33 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  55.41 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  57.35 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  57.35 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  57.83 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  57.35 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  50.67 
 
 		 79 aa  93.6  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  55.88 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  55.88 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  55.88 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  55.88 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  55.88 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  59.15 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  56.63 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  65.22 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  65.22 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  65.22 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  58.11 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  65.22 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  53.25 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  61.97 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  65.15 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  56.92 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  52.08 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  65.22 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  53.01 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  56.52 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  65.57 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  61.43 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  68.66 
 
 		 93 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  57.75 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  53.33 
 
 		 87 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  56.52 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  51.85 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  51.9 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  58.46 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  56.92 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  50.67 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  59.15 
 
 		 76 aa  88.2  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  55.41 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  58.57 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.19 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  62.5 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  57.97 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  57.14 
 
 		 70 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.97 
 
 		 81 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  48.15 
 
 		 81 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  60.61 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  48.15 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  55.56 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  55.71 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  58.46 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  50.72 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  50.75 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>