More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3092 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  296  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  71.43 
 
 		 148 aa  227  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  71.92 
 
 		 148 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  68.28 
 
 		 148 aa  216  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  67.81 
 
 		 148 aa  203  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  62.07 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  61.64 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  64.83 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  60.96 
 
 		 148 aa  190  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  58.22 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  59.59 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  60.69 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  59.59 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  60.96 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  56.16 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  58.28 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  60 
 
 		 151 aa  172  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  54.48 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  56.16 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  60.69 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  55.48 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  54.48 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  54.97 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  54.97 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  54.97 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  56.16 
 
 		 148 aa  159  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  50.68 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  51.37 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  54.05 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  54.67 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  53.74 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  55.17 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.54 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  127  8.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 170 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  42.22 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 193 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 168 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  44.06 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 179 aa  106  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  40.54 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  38.35 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  43.07 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  43.07 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  43.07 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>