More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3062 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  100 
 
 
474 aa  960    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  60.09 
 
 
449 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  50.36 
 
 
441 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.27 
 
 
482 aa  329  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  46.86 
 
 
426 aa  326  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  59.11 
 
 
540 aa  326  7e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  48.5 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  46.36 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  48 
 
 
477 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  45.43 
 
 
421 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  42.93 
 
 
463 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  41.13 
 
 
507 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  45 
 
 
466 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  46.9 
 
 
463 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  57.09 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  43.69 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  46.65 
 
 
462 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  42.68 
 
 
514 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  45.91 
 
 
467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  42.65 
 
 
469 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  39.95 
 
 
519 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  55.56 
 
 
265 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  43.31 
 
 
479 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  46.47 
 
 
491 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.47 
 
 
491 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.47 
 
 
491 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  53.08 
 
 
259 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  56.39 
 
 
474 aa  256  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  36.9 
 
 
500 aa  256  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  55.25 
 
 
253 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.49 
 
 
438 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.79 
 
 
564 aa  248  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  56.83 
 
 
517 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  56.83 
 
 
516 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  55.04 
 
 
247 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  33.06 
 
 
554 aa  230  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.67 
 
 
241 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  50.42 
 
 
241 aa  229  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  52.65 
 
 
255 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  52.97 
 
 
687 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  49.34 
 
 
364 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  51.93 
 
 
511 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  49.81 
 
 
519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  43.2 
 
 
571 aa  201  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  29.65 
 
 
558 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  44.16 
 
 
395 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.64 
 
 
239 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  40.93 
 
 
567 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  46.41 
 
 
369 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  44.73 
 
 
239 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  46.61 
 
 
355 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  42.86 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  47.48 
 
 
239 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 
394 aa  179  9e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  41.63 
 
 
425 aa  176  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  42.42 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  32.73 
 
 
416 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  39.69 
 
 
597 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  42.54 
 
 
236 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  35.98 
 
 
245 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  44.98 
 
 
267 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.96 
 
 
280 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  40.33 
 
 
252 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.24 
 
 
247 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.02 
 
 
237 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
259 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
259 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 
239 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 
415 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  42.56 
 
 
361 aa  156  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  41.18 
 
 
386 aa  156  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.84 
 
 
611 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  37.75 
 
 
276 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  38.15 
 
 
258 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  38.14 
 
 
241 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.65 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  41.06 
 
 
449 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
241 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 
538 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
236 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  35.02 
 
 
323 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
257 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 
319 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  36.51 
 
 
249 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  34.6 
 
 
236 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.86 
 
 
261 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  33.88 
 
 
245 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
254 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.29 
 
 
238 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
548 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 
240 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  38.24 
 
 
261 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
238 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.74 
 
 
320 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  36.32 
 
 
241 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  37.87 
 
 
261 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.66 
 
 
422 aa  144  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
574 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  37.99 
 
 
239 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  34.6 
 
 
313 aa  143  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>