More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3046 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  61.47 
 
 		 591 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 572 aa  1129    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  62.14 
 
 		 567 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  59.61 
 
 		 566 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  56.37 
 
 		 571 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 		 568 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  48.66 
 
 		 573 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.23 
 
 		 573 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 595 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  44.96 
 
 		 577 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 580 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 575 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  44.09 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 568 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 568 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 		 568 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 579 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 565 aa  363  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 631 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  43.17 
 
 		 573 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 543 aa  336  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 556 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  41.73 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  38.17 
 
 		 549 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 525 aa  319  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 568 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 535 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  39.34 
 
 		 543 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 571 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 535 aa  259  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 550 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  32.86 
 
 		 635 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 409 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  36.9 
 
 		 401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  50.54 
 
 		 392 aa  174  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  37.5 
 
 		 385 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 372 aa  170  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  35.04 
 
 		 391 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 		 381 aa  157  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.43 
 
 		 456 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  34.29 
 
 		 851 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  36.6 
 
 		 828 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 		 673 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  39.53 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 386 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 421 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  35.11 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  37.44 
 
 		 382 aa  109  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 		 795 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 725 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.2 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.2 
 
 		 593 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.2 
 
 		 593 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 523 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 665 aa  97.8  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.44 
 
 		 602 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  24.64 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  23.8 
 
 		 516 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 574 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  24.16 
 
 		 523 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  24.36 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  24.28 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  24.16 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.44 
 
 		 623 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32 
 
 		 604 aa  94.7  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  24.04 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.56 
 
 		 603 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  32.74 
 
 		 598 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  32.74 
 
 		 598 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.74 
 
 		 598 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.74 
 
 		 598 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.74 
 
 		 598 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  32.74 
 
 		 598 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.74 
 
 		 598 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.74 
 
 		 598 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.74 
 
 		 598 aa  90.5  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.71 
 
 		 594 aa  90.1  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  23.32 
 
 		 372 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  22.04 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  31.62 
 
 		 622 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  22.04 
 
 		 372 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  22.04 
 
 		 372 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  22.04 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.3 
 
 		 598 aa  88.2  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  22.04 
 
 		 372 aa  87.8  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 3470 aa  87  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  33.88 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>