127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3044 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3044  trehalose 6-phosphate phosphorylase  100 
 
 		 804 aa  1641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.886681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.77 
 
 		 1314 aa  814    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  52.16 
 
 		 1088 aa  818    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  52.16 
 
 		 1215 aa  757    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  64.02 
 
 		 788 aa  1006    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.43 
 
 		 1053 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.24 
 
 		 1051 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  59.47 
 
 		 794 aa  920    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  52.16 
 
 		 1215 aa  757    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  52.28 
 
 		 1225 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  53.93 
 
 		 807 aa  812    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  51.86 
 
 		 807 aa  755    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  52.16 
 
 		 1215 aa  757    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  53.49 
 
 		 1186 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  49.75 
 
 		 1327 aa  727    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  47.76 
 
 		 807 aa  685    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.44 
 
 		 1053 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.95 
 
 		 1051 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.31 
 
 		 1050 aa  652    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.9 
 
 		 1052 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  61.53 
 
 		 713 aa  833    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.19 
 
 		 1125 aa  657    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  42.46 
 
 		 1053 aa  634  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  41.41 
 
 		 1055 aa  635  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  39.36 
 
 		 904 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1283  glycoside hydrolase family protein 65  40 
 
 		 806 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.461041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  35.73 
 
 		 769 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  29.42 
 
 		 780 aa  348  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  30.25 
 
 		 748 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  29.28 
 
 		 755 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  28.11 
 
 		 775 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 978 aa  307  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3525  trehalose 6-phosphate phosphorylase  50.92 
 
 		 450 aa  300  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 759 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  27.78 
 
 		 763 aa  294  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  28.29 
 
 		 965 aa  281  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  26.37 
 
 		 778 aa  279  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.75 
 
 		 759 aa  274  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  31.06 
 
 		 720 aa  272  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  30.64 
 
 		 757 aa  269  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  28.87 
 
 		 787 aa  266  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  28.7 
 
 		 789 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  28.36 
 
 		 769 aa  265  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  31.18 
 
 		 760 aa  262  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.85 
 
 		 762 aa  262  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  29.9 
 
 		 795 aa  257  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  29.42 
 
 		 795 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.35 
 
 		 777 aa  253  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  26.96 
 
 		 787 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  29.83 
 
 		 795 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.02 
 
 		 781 aa  248  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  26.3 
 
 		 780 aa  247  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  30.2 
 
 		 755 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  30.49 
 
 		 755 aa  244  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  30.26 
 
 		 755 aa  244  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  30.26 
 
 		 755 aa  244  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  29.25 
 
 		 790 aa  244  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  29.7 
 
 		 755 aa  243  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  28.96 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  30.12 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  30.12 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  27.88 
 
 		 807 aa  241  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  29.95 
 
 		 755 aa  241  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  27.55 
 
 		 794 aa  237  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  24.59 
 
 		 781 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  28.41 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  29.01 
 
 		 761 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  25.8 
 
 		 774 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  26.29 
 
 		 771 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.42 
 
 		 749 aa  224  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  28.15 
 
 		 825 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  28.61 
 
 		 858 aa  220  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  26.83 
 
 		 753 aa  213  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  24.78 
 
 		 780 aa  211  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  26.02 
 
 		 788 aa  210  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  25.09 
 
 		 805 aa  209  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  25.64 
 
 		 748 aa  204  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.57 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  30.04 
 
 		 780 aa  200  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.89 
 
 		 787 aa  198  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.3 
 
 		 807 aa  198  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  27.77 
 
 		 834 aa  197  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  28.61 
 
 		 704 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  24.33 
 
 		 767 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  24.72 
 
 		 789 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.42 
 
 		 786 aa  195  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  28.68 
 
 		 794 aa  194  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  26.78 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  28.21 
 
 		 784 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  27.83 
 
 		 790 aa  191  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  23.11 
 
 		 768 aa  189  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.11 
 
 		 843 aa  187  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 804 aa  187  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  27.68 
 
 		 776 aa  187  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.2 
 
 		 848 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.27 
 
 		 810 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  25.32 
 
 		 752 aa  182  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  28.82 
 
 		 789 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.4 
 
 		 777 aa  181  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  28.78 
 
 		 784 aa  180  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>