More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3043 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.57 
 
 
252 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.82 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.36 
 
 
244 aa  231  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.27 
 
 
1088 aa  228  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.08 
 
 
1314 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.05 
 
 
525 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.99 
 
 
253 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.18 
 
 
268 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.44 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  43.53 
 
 
1055 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.94 
 
 
248 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.68 
 
 
1051 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.73 
 
 
244 aa  205  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  42.8 
 
 
1053 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.48 
 
 
251 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.44 
 
 
1053 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.64 
 
 
263 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.22 
 
 
263 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.22 
 
 
263 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.77 
 
 
1125 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.68 
 
 
1052 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.74 
 
 
236 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.79 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.66 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.7 
 
 
246 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.23 
 
 
258 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.93 
 
 
249 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.98 
 
 
1051 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.21 
 
 
1053 aa  191  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.92 
 
 
313 aa  191  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.64 
 
 
243 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.95 
 
 
1050 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50 
 
 
243 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.8 
 
 
238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.53 
 
 
250 aa  178  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.76 
 
 
252 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  41.91 
 
 
262 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.48 
 
 
252 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.83 
 
 
246 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.09 
 
 
240 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.89 
 
 
248 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.45 
 
 
223 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  37.44 
 
 
1327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  36.25 
 
 
218 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  32.39 
 
 
219 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  33.19 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.85 
 
 
456 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  34.18 
 
 
219 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  29.22 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.26 
 
 
456 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  33.19 
 
 
216 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.86 
 
 
219 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
456 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  33.74 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.2 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.54 
 
 
207 aa  95.5  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.87 
 
 
215 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.02 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  26.51 
 
 
227 aa  92.4  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  29.91 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.88 
 
 
268 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  33.47 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.47 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  30.7 
 
 
216 aa  85.5  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  32.66 
 
 
219 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.92 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  28.39 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  30.05 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  29.5 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  28.79 
 
 
965 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  26.7 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.23 
 
 
978 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  28.3 
 
 
585 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  27.93 
 
 
221 aa  79  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.93 
 
 
248 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.83 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  29.11 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.1 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  26.26 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  45.9 
 
 
1225 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 
217 aa  77  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  30.46 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  25.85 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  24.17 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  28.37 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  30.05 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.1 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  28.71 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  29.56 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  27.4 
 
 
219 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.96 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  31.69 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.71 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.55 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>