More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3042 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3042  CBS  100 
 
 
241 aa  474  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  53.62 
 
 
228 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  51.54 
 
 
232 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  48.67 
 
 
234 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  43.72 
 
 
227 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  44.1 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  38.2 
 
 
221 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.53 
 
 
218 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  38.39 
 
 
217 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  38.56 
 
 
213 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  34.8 
 
 
222 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  33.33 
 
 
243 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  33.76 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
149 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  33.48 
 
 
241 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.61 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  30.26 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.8 
 
 
155 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  36.99 
 
 
161 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.65 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.13 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.19 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  28.31 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  33.63 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  33.18 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  33.19 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  31.05 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  32.69 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  35.32 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 
152 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  32 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.13 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  32 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  35.26 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  29.69 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  33.62 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.07 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.36 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.65 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  30 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.48 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.8 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.19 
 
 
426 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 
151 aa  72  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.79 
 
 
230 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 
141 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  28.88 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  35.71 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.67 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  30.34 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.21 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  30.57 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  29.87 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  26.94 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  33.33 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.09 
 
 
147 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  38.51 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.8 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  30.32 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
428 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  31.8 
 
 
201 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  33.14 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  29.41 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  30.85 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.22 
 
 
147 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  31.13 
 
 
348 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  34.01 
 
 
153 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 
149 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  35.62 
 
 
427 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 
148 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.23 
 
 
155 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  32.18 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  31 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
149 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  33.77 
 
 
332 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  26.9 
 
 
149 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  31.29 
 
 
339 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 
150 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 
215 aa  62  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 
150 aa  62  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  31.58 
 
 
417 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 
150 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.62 
 
 
161 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.92 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  32.88 
 
 
160 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
385 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 
390 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  34.21 
 
 
330 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.49 
 
 
150 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>