More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2976 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  100 
 
 
367 aa  738    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  49.59 
 
 
373 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  47.73 
 
 
396 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  48.08 
 
 
366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  42.33 
 
 
409 aa  281  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  40.86 
 
 
412 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  38.61 
 
 
416 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  39.3 
 
 
408 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  41.82 
 
 
409 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  39.53 
 
 
416 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  37.53 
 
 
409 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  40.62 
 
 
424 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  37.7 
 
 
412 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.37 
 
 
408 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.35 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  43.71 
 
 
398 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  43.62 
 
 
423 aa  215  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  43.73 
 
 
418 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  41.75 
 
 
426 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.69 
 
 
400 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  41.84 
 
 
412 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.46 
 
 
412 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  40.82 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  40.27 
 
 
419 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  40.82 
 
 
411 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  42.66 
 
 
402 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  40.34 
 
 
411 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  40.82 
 
 
411 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  40.48 
 
 
411 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.52 
 
 
411 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  40 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  40.48 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  40.48 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  40.48 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.97 
 
 
400 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  39.48 
 
 
421 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.31 
 
 
401 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.4 
 
 
411 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  39.23 
 
 
420 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  40.56 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  39.32 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.21 
 
 
399 aa  199  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  37.61 
 
 
398 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.2 
 
 
417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  39.31 
 
 
399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  41.36 
 
 
420 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.93 
 
 
407 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.93 
 
 
407 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  40.07 
 
 
410 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.79 
 
 
400 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  37.35 
 
 
395 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  40.06 
 
 
409 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  36.58 
 
 
406 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  39.76 
 
 
438 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  38.64 
 
 
411 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.84 
 
 
398 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  40.61 
 
 
430 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.56 
 
 
406 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  39.13 
 
 
447 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  39.13 
 
 
447 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  39.13 
 
 
447 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  37.21 
 
 
406 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  37.21 
 
 
406 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  37.21 
 
 
406 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  36.54 
 
 
399 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  36.2 
 
 
444 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.64 
 
 
395 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  39.87 
 
 
407 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  36.14 
 
 
443 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  36.64 
 
 
402 aa  186  8e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  39.07 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  37.12 
 
 
405 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  38.06 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  39.08 
 
 
400 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  38.39 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  37.46 
 
 
395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  36.5 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  36.3 
 
 
402 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.06 
 
 
410 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  34.66 
 
 
399 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  36.15 
 
 
417 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  37.25 
 
 
436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  38.37 
 
 
423 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.06 
 
 
411 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  39.88 
 
 
435 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  36.42 
 
 
406 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  40.34 
 
 
411 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  35.69 
 
 
412 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.38 
 
 
399 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  35.26 
 
 
401 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  36.68 
 
 
398 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  35.84 
 
 
411 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.71 
 
 
394 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  35.19 
 
 
401 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  35.06 
 
 
412 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  38.66 
 
 
387 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.29 
 
 
391 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  36.45 
 
 
408 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.37 
 
 
405 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.24 
 
 
436 aa  176  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>