More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2973 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  100 
 
 
158 aa  322  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  68.35 
 
 
158 aa  220  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  66.46 
 
 
158 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  62.66 
 
 
158 aa  206  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  64.15 
 
 
159 aa  203  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  57.42 
 
 
156 aa  190  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  57.42 
 
 
156 aa  190  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  56.13 
 
 
156 aa  184  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 
155 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 
155 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 
155 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 
155 aa  168  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 
155 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 
155 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 
160 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
155 aa  143  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  49.03 
 
 
156 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  48 
 
 
163 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  33.33 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  32.85 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  32.76 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  34.83 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  34.83 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  31.54 
 
 
530 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
132 aa  61.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  30 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 
236 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  39.47 
 
 
146 aa  60.5  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  46.27 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 
229 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
209 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  30 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  44.12 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  35.79 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  34.48 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  37.65 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  45.45 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
137 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  28.03 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  28.79 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  32.35 
 
 
139 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  30 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  28.79 
 
 
149 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  27.69 
 
 
205 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  26.92 
 
 
205 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  28.32 
 
 
205 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  27.27 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  28.18 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  27.27 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>