More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2956 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 453 aa  920    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  58.33 
 
 		 584 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  47 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.71 
 
 		 468 aa  276  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.44 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.49 
 
 		 480 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.07 
 
 		 618 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  43.04 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  38.5 
 
 		 530 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.39 
 
 		 481 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.83 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  41.16 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  38.9 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.61 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.31 
 
 		 521 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  36.32 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.17 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.77 
 
 		 497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.46 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.45 
 
 		 509 aa  196  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.89 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.24 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  38.05 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.12 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.28 
 
 		 551 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.54 
 
 		 465 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  32.3 
 
 		 734 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.56 
 
 		 390 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.07 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.76 
 
 		 504 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.67 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.91 
 
 		 486 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  31.78 
 
 		 505 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.59 
 
 		 512 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.17 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.45 
 
 		 619 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.1 
 
 		 540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.42 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.28 
 
 		 573 aa  170  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.44 
 
 		 307 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  36.27 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.85 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.3 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.53 
 
 		 643 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.24 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.31 
 
 		 625 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.72 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.65 
 
 		 526 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.98 
 
 		 1336 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.73 
 
 		 320 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.84 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.31 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.23 
 
 		 394 aa  151  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  32.55 
 
 		 684 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.15 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.75 
 
 		 520 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.52 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32.63 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.68 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.54 
 
 		 306 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.43 
 
 		 508 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.08 
 
 		 336 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.35 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.78 
 
 		 560 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.85 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  27.95 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.85 
 
 		 687 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.91 
 
 		 732 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 699 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 699 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 701 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.5 
 
 		 382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.3 
 
 		 495 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.37 
 
 		 377 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.11 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.87 
 
 		 649 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.44 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.66 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.97 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.5 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 311 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 311 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  34.55 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1026  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.999724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.97 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  39.68 
 
 		 296 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.37 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  30.75 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.13 
 
 		 567 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.88 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.65 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1145  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.45 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.61 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 489 aa  123  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.56 
 
 		 404 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 517 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.51 
 
 		 516 aa  122  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>