129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2953 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2953  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  487  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  42.73 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  34.39 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  34.08 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  34.55 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  31.63 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  34.7 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  33.18 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  33.79 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  30.29 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  30.29 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  30.77 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  34.22 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  34.38 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  29.81 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  34.38 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  29.81 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  34.38 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  29.81 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  29.81 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  29.81 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  34.38 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  32.44 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  29.81 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  34.38 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  33.93 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  33.93 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  33.93 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  34.65 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  29.81 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  28.85 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  29.82 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  31.17 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  31.51 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  30.8 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0839  TenA family transcription regulator  29.63 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  29.91 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2131  TenA family transcription regulator  26.82 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00735431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2169  TENA/THI-4 domain-containing protein  26.82 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0930547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1950  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  27.52 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  29.36 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  29.55 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  32.87 
 
 		 518 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  29.41 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  31.13 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  28.77 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  29.55 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  27.85 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  28.5 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  28.5 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  28.5 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  31.86 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1701  TenA family transcription regulator  24.89 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  28.57 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  31.65 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  25.12 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  29.09 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  29.85 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  30.24 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  29.86 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  28.64 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  27.88 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  30.28 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  30.37 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  30.19 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  28.97 
 
 		 499 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  26.21 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  29.05 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4454  TENA/THI-4 domain-containing protein  30.28 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.592634 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  25.47 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  24.41 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  24.88 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4968  transcriptional activator, TenA family  30.28 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.0204405 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  27.23 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  24.17 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  25.94 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  29.61 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  28.64 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  28.91 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2169  transcriptional activator, TenA family  21.36 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  24.2 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  24.26 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  24.2 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  25.26 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  28.5 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  29.27 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  27.27 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  23.74 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  26.87 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  27.49 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  23.27 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  27.65 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0021  TenA family transcription regulator  27.13 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  28.5 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  28.64 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  29.76 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  24.5 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  27.18 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  29.44 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>