More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2943 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  77.78 
 
 		 243 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  52.74 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  51.9 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  50.21 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  45.9 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  47.3 
 
 		 242 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 105 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.21 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  26.95 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  27.54 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  26.23 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.71 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0708  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.82 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0342  transcriptional regulator, GntR family  24.14 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  29.18 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  26.67 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  24.53 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  25 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  24.53 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  25.12 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  25 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0335  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  25 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  25 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  25 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  25 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  25 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  25 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  25 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  26.26 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>