More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2940 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  100 
 
 
155 aa  312  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  62.14 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  56.12 
 
 
142 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  57.04 
 
 
149 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  54.48 
 
 
530 aa  146  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 
141 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 
144 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  43.38 
 
 
127 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  31.39 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  33.33 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  36.92 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  36.92 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  30.88 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  36.92 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  36.92 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  36.64 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  37.27 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.31 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  37.8 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  44.05 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.33 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
305 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
161 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  47.69 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.33 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 
229 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  36 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
218 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  33.64 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5571  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0243609  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
137 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  33.94 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  33.94 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
536 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  46.67 
 
 
184 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  29.17 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  29.17 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  34.69 
 
 
133 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
216 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  33 
 
 
134 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  42.42 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
209 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>