More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2908 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  78.64 
 
 		 220 aa  354  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  66.98 
 
 		 217 aa  297  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  62.96 
 
 		 219 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  59.15 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  53.49 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  54.25 
 
 		 214 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  54.98 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  55.96 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  50.68 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  46.73 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  49.77 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  47.22 
 
 		 222 aa  191  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  46.05 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  46.05 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  46.05 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.33 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  44.29 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  42.47 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  45.5 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  44.19 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  46.3 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  41.43 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  40.48 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  41.71 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  40.48 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  42.18 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  46.92 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  44.5 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  48.57 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  46.19 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.01 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  38.68 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.97 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  38.89 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.56 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  36.49 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  35.91 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  36.07 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  35.81 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  31.92 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.7 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  33.94 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  33.04 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.86 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.92 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.92 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.46 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  31.46 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.39 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  36.02 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  31.46 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  27.93 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  36.02 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  31.28 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.88 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  29.78 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  29.03 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  29.3 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  34.23 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  34.23 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  32.71 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  31.86 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  30.59 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  28.31 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  33.78 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  31.7 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  31.84 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>