77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2818 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  736    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  55.8 
 
 		 368 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  51.25 
 
 		 370 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  52.54 
 
 		 369 aa  352  8e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  53.33 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  50.7 
 
 		 375 aa  349  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  53.61 
 
 		 369 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  53.61 
 
 		 369 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  48.43 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  48.03 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  51.53 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  51.6 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  46.11 
 
 		 376 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  44.54 
 
 		 380 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  51.29 
 
 		 371 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  46.1 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  45.17 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  45.17 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  47.24 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  46.89 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  43.84 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  44.72 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  43.75 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.7 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  43.62 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  44.49 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  44.09 
 
 		 356 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  44.09 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  44.09 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  44.09 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  43.7 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  43.06 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.79 
 
 		 317 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  41.69 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  42.86 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.74 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.54 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.58 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  38.16 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  37.75 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  30.28 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  31.14 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  36.63 
 
 		 406 aa  142  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  32.4 
 
 		 380 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  32.79 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  29.39 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  32.82 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.01 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  36.59 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  28.08 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  31.25 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  29.72 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  22.58 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  29.72 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  25.65 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  23.05 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3454  MJ0042 family finger-like protein  38.1 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.052839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  40.35 
 
 		 571 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0296  hypothetical protein  39.13 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542313  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  36.84 
 
 		 610 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  36.84 
 
 		 605 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  46 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0077  hypothetical protein  38.18 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  31.17 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  34.78 
 
 		 727 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3589  Fimbrial protein pilin  41.67 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  23.65 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  36.51 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0919  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1131 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1651  hypothetical protein  35.48 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0946  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1131 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26112  predicted protein  37.5 
 
 		 169 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213855  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  23.31 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  23.48 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>