More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2816 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 
255 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  35.48 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  33.09 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
291 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  32.24 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
195 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 
196 aa  62  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
261 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  31.78 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  27.61 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  43.28 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 
332 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 
241 aa  58.9  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 
193 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  34.34 
 
 
192 aa  58.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  33.96 
 
 
208 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1823  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
137 aa  58.5  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
260 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.89 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  54.55 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  32.74 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 
189 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
196 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>