37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2813 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  851  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  57.87 
 
 
395 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  41.62 
 
 
371 aa  112  2e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  31.44 
 
 
355 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  31.2 
 
 
378 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  33.65 
 
 
347 aa  93.6  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  33.65 
 
 
347 aa  93.6  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  36.92 
 
 
388 aa  86.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  35.55 
 
 
378 aa  85.1  2e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  27.05 
 
 
347 aa  84.3  3e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  39.88 
 
 
367 aa  84  5e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  32 
 
 
396 aa  82.8  1e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  28.93 
 
 
425 aa  82.4  1e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  27.47 
 
 
399 aa  81.6  2e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  31.98 
 
 
341 aa  76.6  8e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  31.68 
 
 
359 aa  75.9  1e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  29.65 
 
 
365 aa  76.3  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  28.77 
 
 
369 aa  72.4  2e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  27.56 
 
 
373 aa  70.1  8e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.57468e-05 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  29.58 
 
 
379 aa  68.2  3e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  26.13 
 
 
375 aa  68.2  3e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  32.59 
 
 
443 aa  65.9  1e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  26.53 
 
 
369 aa  61.2  4e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  25.8 
 
 
375 aa  58.9  2e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  33.01 
 
 
366 aa  58.5  2e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.2 
 
 
745 aa  58.2  3e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  27.45 
 
 
419 aa  57.8  4e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.07578e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  29.87 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  24.29 
 
 
415 aa  52.8  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  27.01 
 
 
432 aa  52  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  27.01 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  25.75 
 
 
776 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  27.19 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  25.29 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  24.19 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  32.84 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  22.71 
 
 
366 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>