152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2768 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  100 
 
 		 460 aa  899    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  56.07 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  52.06 
 
 		 453 aa  415  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  49.34 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  51.18 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  49.16 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  47.67 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  54.09 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 435 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  34.73 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  34.73 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  30.47 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  29.42 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  30.02 
 
 		 461 aa  216  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  36.25 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  30.4 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  33.92 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  31.9 
 
 		 441 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  32.12 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  31.68 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  31.68 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  31.68 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  31.68 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  31.68 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  31.47 
 
 		 441 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  31.68 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  31.68 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  31.47 
 
 		 441 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  30.31 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  33.19 
 
 		 419 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  29.04 
 
 		 441 aa  196  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  28.04 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  29.07 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  29.32 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  32.07 
 
 		 451 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  27.29 
 
 		 468 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  28.31 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  34.05 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  30.02 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  30.22 
 
 		 432 aa  183  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  30.02 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  29.81 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  29.81 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  29.42 
 
 		 455 aa  180  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  29.81 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  30.67 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  30.55 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  28.33 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  30.36 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  30.36 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  31.57 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  30.36 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  30.24 
 
 		 450 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  30.44 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  28.54 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.62 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  28.54 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.6 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  28.6 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  28.6 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.6 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.33 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  26.01 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  29.25 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.16 
 
 		 442 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  27.33 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  27.85 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  25 
 
 		 438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  28.42 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  25.31 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  26.75 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  28.71 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  28.07 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  27.43 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  27.18 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  23.19 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  23.73 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  25.72 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  25.72 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  25.78 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  25.72 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  25.78 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  25.72 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  25.5 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  26.61 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  25.5 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  27.72 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  24.25 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>