298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2764 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  100 
 
 		 122 aa  242  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  77.24 
 
 		 123 aa  186  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  41.49 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.86 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  36.45 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.93 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  39.36 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  34.19 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  35.29 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 117 aa  66.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  31.19 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.53 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.28 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.46 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  34.26 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  31.53 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  31.53 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  22.92 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  30.36 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  33.93 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  24.32 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  32.08 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  32.94 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  29.63 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.42 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31.68 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.72 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 250 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  35.37 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.39 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.63 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>