34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2749 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2749  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  157  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0897128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4389  hypothetical protein  59.46 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8994  hypothetical protein  52 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542043  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3345  hypothetical protein  54.84 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  0.696912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0297  hypothetical protein  65.38 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7208  hypothetical protein  59.62 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.073484  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0096  hypothetical protein  57.69 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0158  hypothetical protein  57.69 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3552  hypothetical protein  72.22 
 
 
55 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00116548  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0950  hypothetical protein  59.57 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0167  hypothetical protein  57.69 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459821  hitchhiker  0.00010611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3574  hypothetical protein  70.27 
 
 
66 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.021517  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1392  hypothetical protein  46.03 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.343231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2070  hypothetical protein  63.04 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4920  hypothetical protein  53.7 
 
 
59 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4537  hypothetical protein  53.7 
 
 
59 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0021  hypothetical protein  64.71 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.206071 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4624  hypothetical protein  53.7 
 
 
59 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5110  hypothetical protein  50.91 
 
 
61 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122745  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6842  hypothetical protein  72.73 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1637  hypothetical protein  69.7 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656954  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4756  hypothetical protein  67.65 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37790  hypothetical protein  56.25 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.214618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0298  hypothetical protein  53.06 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5982  hypothetical protein  69.7 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10825  hypothetical protein  69.7 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.149368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2350  hypothetical protein  49.12 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06070  hypothetical protein  66.67 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6013  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4314  hypothetical protein  41.79 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5041  hypothetical protein  58.33 
 
 
80 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18640  hypothetical protein  45.61 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00906092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4039  hypothetical protein  60.61 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.689031  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08980  hypothetical protein  39.44 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3514  hypothetical protein  48 
 
 
62 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.365915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>