22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2700 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  228  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  66.95 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  44.55 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  33.08 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  33.64 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  35.16 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  35.85 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  41.96 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  34.21 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  33.02 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  31.9 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  36.13 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  28.97 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  33.06 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  38.71 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  31.58 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  36.19 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  31.31 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17930  hypothetical protein  41.75 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2352  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  31.73 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  27.88 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>