More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2692 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  85.88 
 
 
431 aa  783    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  70.45 
 
 
443 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  70.9 
 
 
446 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 
434 aa  895    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  70.57 
 
 
446 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  76.74 
 
 
438 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  77.46 
 
 
449 aa  691    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  76.81 
 
 
441 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  70.9 
 
 
446 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  72.07 
 
 
445 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  70.9 
 
 
446 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  70.53 
 
 
440 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  70.23 
 
 
440 aa  636    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  68.47 
 
 
442 aa  631  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  70.28 
 
 
426 aa  632  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  67.85 
 
 
441 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  67.68 
 
 
446 aa  614  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  67.14 
 
 
441 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  66.97 
 
 
451 aa  608  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.62 
 
 
444 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  66.19 
 
 
482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  66.67 
 
 
457 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  67.37 
 
 
448 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  66.43 
 
 
483 aa  581  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  65.31 
 
 
445 aa  581  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  67.37 
 
 
426 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  64.67 
 
 
460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  64.62 
 
 
459 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.35 
 
 
447 aa  565  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  63.55 
 
 
450 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  66.12 
 
 
446 aa  559  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.97 
 
 
417 aa  426  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  50 
 
 
411 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.59 
 
 
417 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.59 
 
 
417 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.23 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.19 
 
 
390 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.65 
 
 
422 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.89 
 
 
415 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.3 
 
 
401 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.25 
 
 
390 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.72 
 
 
389 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.28 
 
 
403 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.5 
 
 
390 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.5 
 
 
390 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.23 
 
 
389 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.47 
 
 
414 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
416 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  45.52 
 
 
388 aa  363  3e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.12 
 
 
404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  45.02 
 
 
397 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
390 aa  360  4e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  44.47 
 
 
406 aa  359  7e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  43.53 
 
 
475 aa  356  5e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.87 
 
 
400 aa  356  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 
396 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  42.48 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.58 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.32 
 
 
393 aa  353  4e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  43.12 
 
 
417 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.32 
 
 
396 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  43.59 
 
 
417 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.87 
 
 
396 aa  348  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.84 
 
 
396 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.84 
 
 
396 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.39 
 
 
791 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  41.97 
 
 
417 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.6 
 
 
396 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  41.59 
 
 
435 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.12 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  41.74 
 
 
417 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  41.97 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  44.33 
 
 
396 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  43.12 
 
 
417 aa  342  9e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  41.72 
 
 
417 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  41.72 
 
 
417 aa  342  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  42.66 
 
 
417 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  42.76 
 
 
402 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  41.96 
 
 
417 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  42.76 
 
 
404 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  43.87 
 
 
396 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  43.38 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  41.28 
 
 
417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.9 
 
 
793 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  43.87 
 
 
402 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  42.99 
 
 
402 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  43.87 
 
 
402 aa  339  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  43.24 
 
 
416 aa  339  7e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  43.84 
 
 
396 aa  338  9e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  44.09 
 
 
396 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.41 
 
 
792 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.54 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  42.07 
 
 
371 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  41.06 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  43.83 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  40.92 
 
 
417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  40.92 
 
 
417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  43.63 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>