More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2635 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 101 aa  197  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  83.17 
 
 		 101 aa  170  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  78.22 
 
 		 100 aa  147  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  69.23 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  65.71 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  63.46 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 104 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  59 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  56.9 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0432  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0323669  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  49.02 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4265  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655615  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  50.45 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  55.06 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 102 aa  93.6  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  50.45 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  52.81 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  51.69 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  47.96 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>