63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2600 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  832  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  57.92 
 
 
428 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  52.33 
 
 
388 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  54.35 
 
 
415 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  46.36 
 
 
396 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  48.42 
 
 
388 aa  275  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  44.59 
 
 
438 aa  269  9e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  44.71 
 
 
400 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  42.34 
 
 
418 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  44.32 
 
 
400 aa  259  5e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  50.43 
 
 
428 aa  254  2e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  43.01 
 
 
414 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  38.63 
 
 
392 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  45.01 
 
 
422 aa  244  2e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  44.79 
 
 
407 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  42.34 
 
 
411 aa  235  1e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82332e-08 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  45.4 
 
 
403 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  49.03 
 
 
411 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  41.81 
 
 
396 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  39.12 
 
 
412 aa  223  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  35.51 
 
 
385 aa  196  5e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  40.31 
 
 
443 aa  173  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  34.8 
 
 
487 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  33.82 
 
 
477 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  38.16 
 
 
372 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  35.83 
 
 
399 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  37.29 
 
 
383 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  36.61 
 
 
382 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  37.88 
 
 
381 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  34.16 
 
 
474 aa  140  5e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  37.05 
 
 
399 aa  132  8e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  34.82 
 
 
412 aa  132  1e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  34.82 
 
 
412 aa  132  1e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  34.82 
 
 
369 aa  132  2e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  131  2e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  35.69 
 
 
358 aa  129  8e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  34.65 
 
 
416 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  3.64534e-05 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  29.97 
 
 
444 aa  120  5e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  29.27 
 
 
420 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  27.64 
 
 
402 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  26.36 
 
 
399 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.81 
 
 
401 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  25.74 
 
 
375 aa  81.3  3e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  25.42 
 
 
419 aa  78.2  2e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  20.7 
 
 
393 aa  70.1  8e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  25.78 
 
 
417 aa  69.7  1e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  23.49 
 
 
385 aa  68.9  2e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  21.73 
 
 
396 aa  66.2  9e-10  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  24.92 
 
 
357 aa  64.7  3e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  25.57 
 
 
383 aa  54.7  3e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  22.09 
 
 
399 aa  52.4  2e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  24.33 
 
 
408 aa  50.1  8e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  22.34 
 
 
394 aa  50.1  9e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  42.25 
 
 
292 aa  49.7  9e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.85 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  24.48 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  30.23 
 
 
289 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
199 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.7 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  38.96 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58562  predicted protein  23.21 
 
 
279 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0813846  normal  0.776229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3281  methyltransferase type 11  50.82 
 
 
285 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  normal  0.615609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
253 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>