More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2534 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  83.54 
 
 		 243 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  79.1 
 
 		 244 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  73.55 
 
 		 243 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  75.31 
 
 		 243 aa  360  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  75 
 
 		 243 aa  358  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  72.02 
 
 		 243 aa  344  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  56.61 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.93 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  33.88 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  29.92 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  34.45 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  28.98 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.54 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  31.67 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.38 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.57 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.64 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  27.64 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.53 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  27.76 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.49 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  27.6 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  31.38 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  33.58 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.55 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.46 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.06 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  33.86 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  24.38 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  32 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  28 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  30.71 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.51 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.83 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  30.98 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  34.43 
 
 		 384 aa  65.5  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  23.97 
 
 		 348 aa  65.1  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.9 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  28.02 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  29.3 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  29.3 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  28.02 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  29.47 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.35 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  26.32 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  24.37 
 
 		 616 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  25.33 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  23.98 
 
 		 325 aa  62  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  46.25 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.03 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  33.89 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.39 
 
 		 776 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  26.32 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  25.1 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  26.02 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.13 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  26.02 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  26.42 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  26.02 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  26.02 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  35.78 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  26.1 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.72 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  29.71 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  26.02 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  26.02 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  26.02 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.35 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  26.37 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.05 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  31.13 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  24.18 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  34.82 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.46 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  32.26 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.29 
 
 		 561 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.29 
 
 		 561 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.32 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.29 
 
 		 561 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  31.06 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  42.86 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 828 aa  58.9  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  26.11 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.29 
 
 		 562 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  26.29 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.9 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.7 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>