More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2495 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.38 
 
 		 605 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  100 
 
 		 579 aa  1160    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  60.12 
 
 		 594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  63.31 
 
 		 594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  55.56 
 
 		 579 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.09 
 
 		 575 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  48.8 
 
 		 608 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  50.79 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  48.46 
 
 		 544 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  49.23 
 
 		 567 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  46.58 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 		 539 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.41 
 
 		 547 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.86 
 
 		 552 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 		 581 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 601 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 		 551 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 		 577 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  47.88 
 
 		 557 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  45.44 
 
 		 574 aa  402  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 		 589 aa  402  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  48.14 
 
 		 801 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  46.12 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  47.12 
 
 		 557 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  44.95 
 
 		 586 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  45.75 
 
 		 554 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  47.99 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  46.07 
 
 		 648 aa  362  8e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 607 aa  349  6e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 538 aa  316  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  52.26 
 
 		 572 aa  316  7e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 565 aa  296  9e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  34.14 
 
 		 482 aa  194  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.86 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.9 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  33.42 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  30.58 
 
 		 450 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 613 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 425 aa  167  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 640 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  36.68 
 
 		 364 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  36.68 
 
 		 364 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25 
 
 		 473 aa  161  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  31.87 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  32.3 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.99 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 473 aa  157  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.16 
 
 		 310 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  32.99 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  27.03 
 
 		 484 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  30.41 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.22 
 
 		 496 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.55 
 
 		 508 aa  154  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.21 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 473 aa  153  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 437 aa  153  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 484 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  29.81 
 
 		 467 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 455 aa  151  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 581 aa  149  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 639 aa  150  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 639 aa  150  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  32.93 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 483 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.63 
 
 		 503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  31.78 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.7 
 
 		 477 aa  147  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  31.49 
 
 		 518 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 518 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.55 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  30.09 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 584 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.13 
 
 		 512 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 613 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>