22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2448 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  72.41 
 
 		 328 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  69.76 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  53 
 
 		 296 aa  298  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  51.24 
 
 		 300 aa  292  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  48.64 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  48.82 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  43.82 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  37.5 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  38.19 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  37.18 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  37.32 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  37.09 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  37.09 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  32.47 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  33.08 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  30.36 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  29.41 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  30.19 
 
 		 453 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  24.61 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  23.7 
 
 		 217 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>