74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2434 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  56.12 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  43.36 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  40.58 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  40.52 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  36.92 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  42.66 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  30.27 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  34.26 
 
 		 303 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  33.93 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  37.2 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  50.34 
 
 		 364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  27.47 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  26.92 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  26.42 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  26.74 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  37.29 
 
 		 434 aa  99  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  25.91 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  51.76 
 
 		 1048 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  27.55 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  25.55 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  34.22 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.11 
 
 		 554 aa  79.3  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  37.93 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  41.84 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  46.81 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.43 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  40.7 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.88 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  32.23 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  24.31 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  47.06 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  34.65 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  41.67 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  41.67 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  41.67 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  47.06 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  40.71 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  25.14 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  36.56 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  36.56 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  33.02 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  33.02 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  36.89 
 
 		 682 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  24.26 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  44.71 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  34.06 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  34.91 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  27.49 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  23.39 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  30.71 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  23.4 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  23.13 
 
 		 366 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  20.67 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  30.34 
 
 		 985 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  33.62 
 
 		 526 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  34.95 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  34.95 
 
 		 199 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  34.95 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  26.8 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  33.03 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  33.03 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  33.03 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  24.06 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1417  hypothetical protein  31.4 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.83 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  29.46 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  31.43 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 767 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  20.48 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  21.37 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>